2007年02月 在第二屆北方期刊獎評選中榮獲十佳期刊獎、優秀期刊獎

　　2007年08月 榮獲首屆吉林省高校科學研究促進獎

　　2008年01月 在吉林省第八次期刊等級評審中榮獲十佳科技期刊獎

　　2008年10月 榮獲第二屆中國高校精品科技期刊獎

　　2008年10月 榮獲高�？萍计诳�先進集體獎

　　2009年10月 榮獲中國高等學校自然科學學報研究會評選的2009年全國高�？萍计诳瘍炐憔庉嬞|量獎

　　2009年11月 在由吉林省委宣傳部、省新聞出版局組織的第九次(2007~2008年度)全省期刊等級評審工作中被評為吉林省一級期刊、吉林省名刊

　　2009年12月 在第二屆吉林省新聞出版獎評選工作中榮獲“第二屆吉林省新聞出版獎的期刊精品獎”稱號

　　2010年11月 榮獲“第三屆中國高校精品科技期刊”稱號

　　2011年05月 在第二屆中國學術期刊評價中被評為“RCCSE中國權威學術期刊”(注：RCCSE為中國科學評價研究中心英文縮寫)

　　2011年05月 在由教育部科技發展中心舉辦的“中國科技論文在線優秀期刊”評比活動中獲一等獎

　　2011年10月 在由教育部科學技術司舉辦的“2011年中國高�？萍计诳瘍炐銏F隊和優秀個人評選活動”中被評為中國高校科技期刊優秀團隊

　　2012年10月 榮獲教育部2011年度中國科技論文在線優秀期刊一等獎

　　2012年11月 榮獲教育部第四屆中國高校精品科技期刊獎

　　2013年11月 在由教育部科技發展中心舉辦的2012年度“中國科技論文在線優秀期刊”評比活動中獲一等獎

　　2013年9月 在由教育部科學技術司舉辦的中國高�？萍计诳瘍炐阒骶幵u比活動中，王麗同志被評為“2013年中國高�？萍计诳瘍炐阒骶�”

　　2014年7月 榮獲中國高校科技期刊研究會評選的“中國高校醫學期刊最佳實踐獎”

　　2014年10月 榮獲教育部科學技術司評選的“第五屆中國高校優秀科技期刊獎”

　　2015年12月 在由教育部科技發展中心舉辦的2014年度“中國科技論文在線優秀期刊”評比活動中獲一等獎

　　2016年10月 在吉林省高校科技期刊“四個獎”評選活動中榮獲先進集體獎

　　2016年10月 榮獲中國高校科技期刊研究會2016年度中國高校優秀科技期刊獎

　　2017年9月 《吉林大學學報(醫學版)》榮獲吉林省高校科技期刊研究會首屆吉林省高�？萍计诳�獎精品獎

　　2018年6月 《吉林大學學報(醫學版)》在由教育部科技發展中心舉辦的2016年度“中國科技論文在線優秀期刊”評比活動中榮獲一等獎

　　2018年10月 榮獲中國高校科技期刊研究會“2018年度中國高校百佳科技期刊”

　　2018年10月 在2018年吉林省高校科技期刊“三優一先”遴選活動中榮獲先進集體獎

　　2019年7月 榮獲“第二屆吉林省高�？萍计诳�獎精品獎”

　　2019年10月 榮獲中國高校科技期刊研究會“中國高�？萍计诳瘍炐銏F隊”

　　2020年8月 官鑫編輯榮獲“第四屆中國科技期刊青年編輯大賽”三等獎

　　2020年9月 韓宏志編輯獲“中國高�？萍计诳�研究會青年基金課題”B類基金資助

　　2020年11月 《吉林大學學報(醫學版)》榮獲中國高校科技期刊研究會“2020年度中國高校百佳科技期刊”

　　2020年12月 《吉林大學學報(醫學版)》編輯部榮獲“第五屆吉林省新聞出版優秀集體獎”

　　2021年10月 《吉林大學學報(醫學版)》榮獲“第三屆吉林省高�？萍计诳�獎”特別獎

　　2021年10月 王麗編審榮獲吉林省高�？萍计诳�研究會的“終身成就獎”

　　2021年10月 韓宏志編審榮獲2020年度吉林省高校科技期刊“優秀編輯”獎

　　2021年10月 官鑫副編審榮獲2020年度吉林省高�？萍计诳�“優秀青年編輯”獎

　　2022年12月 《吉林大學學報(醫學版)》榮獲“2022中國高校百佳科技期刊”

　　2022年12月 《吉林大學學報(醫學版)》在2022年度吉林省高�？萍计诳�高質量發展計劃被遴選為先進集體

　　2023年11月 《吉林大學學報(醫學版)》編輯部榮獲2023年度中國高�？萍计诳�建設示范案例庫優秀團隊

　　2023年11月 《吉林大學學報(醫學版)》官鑫副編審榮獲2023年度中國高�？萍计诳�建設示范案例庫優秀編輯

　　2024年10月 李欣欣編審榮獲2024年度吉林省高校科技期刊“優秀主編”獎

　　2024年10月 韓宏志編審榮獲2024年度吉林省高�？萍计诳�“優秀編輯”獎