基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)最新期刊目錄

堿基編輯系統(tǒng)開發(fā)及應(yīng)用進(jìn)展————作者：周方方;史遠(yuǎn)遠(yuǎn);黃佳穎;

摘要：單核苷酸變異是基因組中常見的變異形式，對生命健康、農(nóng)藝性狀等有關(guān)鍵影響，開發(fā)單核苷酸基因編輯工具可有效實(shí)現(xiàn)疾病治療、農(nóng)業(yè)育種等重要應(yīng)用。堿基編輯系統(tǒng)作為一種新型基因編輯技術(shù)，能夠在不引起DNA雙鏈斷裂且無需供體DNA的情況下，實(shí)現(xiàn)基因組單堿基的精確編輯，從而規(guī)避了傳統(tǒng)CRISPR/Cas9系統(tǒng)可能帶來的細(xì)胞毒性問題。本文系統(tǒng)總結(jié)了堿基編輯系統(tǒng)的多種類型及其應(yīng)用范疇，深入探討了堿基編輯系統(tǒng)在效率、特...

跨膜前后軸轉(zhuǎn)換1蛋白結(jié)構(gòu)及其在視神經(jīng)發(fā)育中的功能研究————作者：鄧蓓;王萌;段寶珍;孫增先;董淑波;侍慧慧;

摘要：為探討跨膜前后軸轉(zhuǎn)換1（transmembrane anterior-posterior axis transition 1，TAPT1）蛋白的功能及其在視神經(jīng)發(fā)育中的調(diào)控機(jī)制，本研究應(yīng)用ProtParam、SOPMA、Phyre 2.2、SMART等在線分析預(yù)測網(wǎng)站對TAPT1蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析，解析該蛋白的基本結(jié)構(gòu)。同時(shí)，以斑馬魚（Danio rerio）為模式動(dòng)物，通過原位雜交技術(shù)構(gòu)建t...

CRISPR-Cas核酸酶家族的系統(tǒng)分類及挖掘方法研究進(jìn)展————作者：李百濤;鄭越;

摘要：CRISPR-Cas系統(tǒng)是細(xì)菌、古菌以及噬菌體抵抗外源核酸入侵的一種適應(yīng)性免疫系統(tǒng)，在真核細(xì)胞基因組編輯中具有廣泛應(yīng)用，并在基礎(chǔ)科研、遺傳病治療、動(dòng)植物育種等領(lǐng)域取得了重要成果。伴隨著基于序列或結(jié)構(gòu)的挖掘方法的不斷開發(fā)和迭代，科學(xué)家們從原核生物基因組數(shù)據(jù)庫及環(huán)境宏基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定出了一系列編輯特性豐富、適用于不同編輯場景需求的CRISPR-Cas家族，極大地?cái)U(kuò)充了可用的基因編輯工具箱。目前，已鑒...

可誘導(dǎo)的CRISPR-dCas9基因表達(dá)調(diào)控策略與方法————作者：王清灝;曹浩博;吳雨璇;李逸豪;

摘要：CRISPR系統(tǒng)作為一種高效、精確的基因編輯工具，已被廣泛應(yīng)用于基因功能研究、疾病治療和生物技術(shù)開發(fā)。近年來，通過改造CRISPR系統(tǒng)，尤其是dCas9蛋白和sgRNA，研究人員開發(fā)出多種基因表達(dá)調(diào)控策略。其中可誘導(dǎo)的CRISPR基因表達(dá)調(diào)控系統(tǒng)通過整合外部刺激響應(yīng)元件(如光、化學(xué)小分子、溫度等)，實(shí)現(xiàn)了對基因表達(dá)的時(shí)間和空間精準(zhǔn)控制。本文綜述了基于CRISPR系統(tǒng)的基因表達(dá)調(diào)控策略與方法的最新進(jìn)...

CRISPR/Cas9、單堿基編輯器和引導(dǎo)編輯器治療β-血紅蛋白遺傳病的進(jìn)展與挑戰(zhàn)————作者：支勝堯;羅曉彤;

摘要：β-地中海貧血和鐮狀細(xì)胞病是由β珠蛋白基因突變引起的兩種常見單基因遺傳病。它們的顯著特征是血紅蛋白合成異常，造成患者終身定期輸血維持生命，并伴隨多種并發(fā)癥。異體造血干細(xì)胞移植（hematopoietic stem cell transplantation， HSCT）是主要的治愈血紅蛋白遺傳病的臨床策略。然而，由于人類白細(xì)胞抗原（human leukocyte antigen， HLA）配型相合供...

CRISPR技術(shù)介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控及表觀修飾————作者：王峻峰;張毅;

摘要：成簇規(guī)律間隔短回文重復(fù)序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeat， CRISPR）技術(shù)自問世以來，因其操作的簡易性和多功能性，在基因編輯領(lǐng)域引發(fā)了革命性的變化。除了基因定點(diǎn)敲除、插入或替換，CRISPR技術(shù)還被改造并應(yīng)用于其它研究領(lǐng)域，如基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控、表觀遺傳修飾等。本文首先對CRISPR技術(shù)的分類和作用原理進(jìn)行概述，然后...

新疆四爪陸龜線粒體基因組特征與系統(tǒng)發(fā)育分析————作者：王偉亮;陳奉欣;劉開平;李村院;胡圣偉;倪偉;

摘要：四爪陸龜（Testudo horsfieldii）自1973年在我國新疆伊犁地區(qū)發(fā)現(xiàn)以來，由于其珍稀性與中生代孑遺地位而引起關(guān)注，但分子生態(tài)學(xué)研究仍較匱乏。本文針對新疆四爪陸龜，參照土庫曼斯坦種群線粒體基因組序列（NC＿007697），設(shè)計(jì)26對特異引物并進(jìn)行了PCR擴(kuò)增，采用Sanger測序獲取完整線粒體基因組（16 917 bp）。結(jié)果顯示，基因組A+T含量達(dá)60.55%，呈顯著AT偏倚，含1...

RNA病毒載體介導(dǎo)的植物基因組編輯研究進(jìn)展————作者：張燕;陳軍;崔凱;吉萬全;李停棟;

摘要：基因組編輯技術(shù)在植物育種和功能基因研究中發(fā)揮重要作用，但限制基因組編輯在植物上應(yīng)用的一個(gè)關(guān)鍵因素是遺傳轉(zhuǎn)化困難或效率較低。目前最常用的農(nóng)桿菌（Agrobacterium）或基因槍介導(dǎo)植物遺傳轉(zhuǎn)化方法需要復(fù)雜組織培養(yǎng)和再生的過程，并且在進(jìn)行基因編輯時(shí)往往要先通過篩選獲得轉(zhuǎn)基因植株，然后再進(jìn)行突變體鑒定。近年來，RNA病毒載體作為一種新興的植物基因組編輯遞送工具，在本氏煙草（Nicotiana ben...

不同品種及管理方式葡萄根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和功能比較分析————作者：黃松林;丁卓然;徐小龍;王博;陳玲玲;

摘要：葡萄（Vitis）是一種廣泛種植的果樹，具有多樣化的用途和重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。植物土壤微生物群落對植物的生長發(fā)育至關(guān)重要，本研究基于細(xì)菌核糖體RNA（16S rRNA）和真菌內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)（internal transcribed spacer， ITS）擴(kuò)增子測序技術(shù)對同一地區(qū)不同品種葡萄和百香果（Passiflora）根際土壤微生物的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行了比較，分析不同品種葡萄和百香果根際土壤微生物群落...

基于轉(zhuǎn)錄組分析鋅指轉(zhuǎn)錄因子ZFP1在滇黃精根腐致病尖孢鐮刀菌生長中的調(diào)控機(jī)制————作者：李怡萌;王景怡;唐晶瑩;蘇建云;董家紅;季鵬章;張磊;

摘要：為探索鋅指轉(zhuǎn)錄因子ZFP1（zinc finger transcription factor ZFP1）在滇黃精（Polygonatum kingianum）根腐致病尖孢鐮刀菌（Fusarium oxysporum）菌絲生長、孢子產(chǎn)生和致病力中的作用機(jī)制，本研究對尖孢鐮刀菌野生型菌株WT＿Fo、ZFP1基因缺失菌株DEL＿Fo和回補(bǔ)菌株COM＿Fo進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析。結(jié)果表明，DEL＿Fo和WT＿...

基于圖注意力網(wǎng)絡(luò)(GAT)的單細(xì)胞類型注釋方法研究————作者：孫熠偉;徐淑坦;

摘要：單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（single-cell RNA sequencing， scRNA-seq）在揭示細(xì)胞異質(zhì)性方面具有重要意義，但現(xiàn)有細(xì)胞類型注釋方法存在著跨物種適應(yīng)性、泛化性、類別不平衡等問題。本文提出了一種基于圖注意力網(wǎng)絡(luò)（graph attention network， GAT）的細(xì)胞類型注釋方法——ScLabeler。該方法通過結(jié)合類別均衡優(yōu)化策略和圖注意力機(jī)制，增強(qiáng)了細(xì)胞間的復(fù)雜關(guān)系的捕...

低氧脅迫對青海湖裸鯉鰓組織中免疫相關(guān)基因表達(dá)的影響————作者：馬淑兄;賈春艷;王璐;霍柯帆;陳艷霞;李瑾;祁洪芳;劉揚(yáng);金文杰;

摘要：低氧是魚類在水體環(huán)境中生存時(shí)經(jīng)常面對的問題之一，其對魚體免疫調(diào)節(jié)能力有至關(guān)重要的影響。為探究低氧脅迫對青海湖裸鯉（Gymnocypris przewalskii）免疫調(diào)節(jié)能力的影響，本研究以轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析為基礎(chǔ)，探討低氧脅迫下鰓組織中免疫相關(guān)基因的表達(dá)情況。選取1齡期的青海湖裸鯉經(jīng)低氧脅迫0、30、40和50 min后，取鰓組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析。對比分析空白對照組與3個(gè)低氧脅迫組之間基因的差異表達(dá)...

無乳鏈球菌母源毒株HN016和弱毒株YM001感染羅非魚血液代謝組學(xué)變化的初步研究————作者：蘇美珍;易丹丹;韋信賢;雷愛瑩;楊彥豪;童桂香;覃幼潔;譚紅連;何鑫;李莉萍;

摘要：本研究旨在探討無乳鏈球菌（Streptococcus agalactiae）母源毒株HN016與弱毒株YM001對羅非魚血液代謝組的影響，以期為乳鏈球菌感染機(jī)制及弱毒株YM001疫苗免疫機(jī)制的研究提供理論基礎(chǔ)。運(yùn)用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法技術(shù)測定羅非魚（Oreochromis niloticus）血液中代謝物，并通過主成分分析（Principal Component Analysis， PCA）和偏最...

一體兩翼五核心“五有”領(lǐng)軍型人才培養(yǎng)體系建設(shè)探索——以涉農(nóng)學(xué)院為例————作者：司紅彬;沈水寶;

摘要：在當(dāng)今全球化競爭激烈的背景下，領(lǐng)軍型人才對國家和社會(huì)進(jìn)步至關(guān)重要。廣西大學(xué)致力于“雙一流”建設(shè)，旨在培養(yǎng)具有社會(huì)責(zé)任、法治意識(shí)、創(chuàng)新精神、實(shí)踐能力與國際視野的“五有”領(lǐng)軍型人才。針對綜合性大學(xué)中新農(nóng)科師資力量薄弱、產(chǎn)教融合不足、人才評價(jià)體系固化等問題，本文提出構(gòu)建“一體兩翼五核心”人才培養(yǎng)體系：以產(chǎn)學(xué)研融合為主體，強(qiáng)化科學(xué)合理的評價(jià)體系與高素質(zhì)師資隊(duì)伍為兩翼；通過學(xué)生入企、引企駐校等措施聚焦培養(yǎng)學(xué)...

杉木ClMYB5基因cDNA的克隆、表達(dá)特性與互作蛋白研究————作者：李翠萍;張子健;文婭婷;徐增富;李魁鵬;

摘要：杉木(Cunninghamia lanceolata)是我國南方主要的用材樹種，具有廣泛的用途。MYB轉(zhuǎn)錄因子家族在植物的生長、發(fā)育、非生物脅迫應(yīng)答以及類黃酮生物合成等方面起到重要的調(diào)控作用。本研究克隆了與擬南芥(Arabidopsis thaliana)AtMYB5基因同源的杉木ClMYB5基因cDNA,對其進(jìn)行生物信息學(xué)、表達(dá)特性及互作蛋白分析。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示，ClMYB5蛋白為既親水...

全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定水稻中細(xì)菌性條斑病的抗性位點(diǎn)————作者：楊梅;牛鵬威;陳美伶;陳福平;陳曼妮;岑衛(wèi)健;羅繼景;

摘要：由革蘭陰性菌水稻黃單胞菌(Xanthomonas Campestris pv.oryzae, Xoc)引起的細(xì)菌性條斑病(bacterial leaf streak, BLS)是水稻生產(chǎn)區(qū)最具破壞性的病害之一，尤其是在潮濕的熱帶、亞熱帶地區(qū)。本研究通過對152份不同水稻(Oryza sativa)種質(zhì)進(jìn)行細(xì)菌性條斑病的抗性表型鑒定，并結(jié)合SNP數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide as...

秦巴野桑蠶(Bombyx mandarina)基因組測序組裝與蛹滯育時(shí)期的全基因組甲基化分析————作者：孟剛;楚渠;王瑞嫻;楊金宏;張?bào)显?陳安利;呂婷;彭云武;凌君;

摘要：為研究野桑蠶(Bombyx mandarina)全基因組甲基化特性及蛹滯育與基因組DNA甲基化關(guān)系，本研究首先測序組裝了秦巴野桑蠶基因組，在此基礎(chǔ)上對不同時(shí)期的蛹滯育材料進(jìn)行基因組甲基化測序，分析DNA甲基化特征，鑒定差異甲基化區(qū)域及相關(guān)基因。結(jié)果表明，秦巴野桑蠶基因組大小為457.85 Mb,蛋白編碼基因12 280個(gè)，rRNA、 sRNA、 tRNA分別為158、 6 951和778個(gè)，同時(shí)鑒...

基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)作者投稿指南

摘要：<正>1刊登范圍本刊主要刊登植物、動(dòng)物和微生物基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等組學(xué),分子醫(yī)學(xué)、現(xiàn)代生物技術(shù)等應(yīng)用生物學(xué)研究的未發(fā)表的創(chuàng)新性研究成果,以及上述領(lǐng)域的綜述論文。2欄目設(shè)置本刊設(shè)置固定欄目和隨機(jī)欄目。固定欄目常設(shè)研究論文,發(fā)表最新的原始研究成果。隨機(jī)欄目根據(jù)稿源設(shè)述評及其他欄目

基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)論文撰寫指南

摘要：<正>一、欄目設(shè)置本刊設(shè)置固定欄目和隨機(jī)欄目。固定欄目常設(shè)研究論文,發(fā)表最新的原始研究成果。隨機(jī)欄目根據(jù)稿源設(shè)述評及其他欄目。二、論文寫作的基本要求1題目與標(biāo)題論文題目要緊扣主題,務(wù)求簡明、新穎,有足夠的信息,能引起讀者的興趣,不用副標(biāo)題,一般不宜超過25個(gè)漢字或英文單詞。應(yīng)使用標(biāo)準(zhǔn)術(shù)語、學(xué)名全稱、藥物和化學(xué)品通用名稱,不宜使用廣義術(shù)語、夸張?jiān)~語等,同時(shí)避免在題目中使用不常用的縮寫詞

適應(yīng)喀斯特與非喀斯特生境的兩種天葵屬植物的基因組特征研究————作者：莫曉芫;張強(qiáng);黃夕洋;吳磊;覃信梅;

摘要：為探索適應(yīng)不同生境基質(zhì)植物基因組特征變異規(guī)律，本研究以生長在喀斯特石灰?guī)r上特有種廣西天葵（Semiaquilegia guangxiensis）和與之近緣且主要生長在泥土上的廣布種天葵（Semiaquilegia adoxoides）為研究對象，利用流式細(xì)胞術(shù)和基于二代測序的基因組Survey分析，評估基因組大小、雜合率、重復(fù)序列、 GC含量和倍性，比較和分析基因組特征差異。流式細(xì)胞術(shù)預(yù)估廣西天葵...

　　基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)來自網(wǎng)友的投稿評論：

• 奔跑的辣椒醬

  初審1個(gè)月，復(fù)審不到2個(gè)月，都是3個(gè)多月給出采用結(jié)果，基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)雜志的論文格式一定要清晰，基本上不會(huì)有什么問題。審稿意見都比較正面，也有些無關(guān)緊要的問題，給審稿人良好的印象顯然會(huì)增加錄用概率。

  2024-08-25 10:15
• 畫個(gè)圈圈兜住幸福

  該期刊為北大核心、CSCD核心期刊，收稿和審稿速度較快。從今年8.31日投稿到錄用不到2個(gè)月的時(shí)間，可以反映出該期刊處理稿件效率很高。其次，在審稿過程中，審稿專家專業(yè)的點(diǎn)評和主編老師專業(yè)的修改要求，使我的論文質(zhì)量有了很大提升，既有挑戰(zhàn)，更是學(xué)習(xí)。另外，在修稿過程中編輯部老師非常認(rèn)真負(fù)責(zé)，打電話發(fā)郵件都能及時(shí)回復(fù)，并總是耐心地解答所有問題。最后，校稿時(shí)主編特別認(rèn)真地調(diào)整了我文章的各種字體、表格以及標(biāo)點(diǎn)符號(hào)。無論是嚴(yán)謹(jǐn)專業(yè)的態(tài)度、專業(yè)知識(shí)的理解還是言語措辭的功底都令我受益匪淺。總之，期刊處理稿件速度很快，編輯老師認(rèn)真負(fù)責(zé)，才使此次投稿非常順利！最后，祝《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》期刊越辦越好！

  2022-11-02 09:27

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