1992年獲全國優秀科技期刊二等獎;1995年獲四川省十佳期刊稱號;1997年獲全國優秀科技期刊三等獎;2000年獲四川省第二屆優秀期刊一等獎;2001年進入中國期刊方陣“雙百”期刊行列;2003年獲第二屆國家期刊獎百種重點期刊獎;2004年獲教育部組織的全國高校優秀科技期刊評比二等獎;2005年獲教育部組織的全國高校科技期刊先進集體稱號;2006年獲教育部首屆中國高校優秀科技期刊獎;2007年獲第一屆四川出版期刊獎一等獎;2008年教育部中國高校精品科技期刊獎、教育部全國高校科技期刊先進集體稱號、“中國精品科技期刊”、全國抗震救災宣傳報道先進期刊、教育部第二屆中國高校精品科技期刊獎、高校科技期刊先進集體;2009年獲第二屆四川出版期刊獎一等獎、全國高校科技期刊優秀編輯質量獎;2010年獲第三屆中國高校精品科技期刊獎;2011年網站獲中國高校科技期刊優秀網站、中國高校科技期刊優秀團隊;2012年獲第四屆中國高校優秀科技期刊獎;2013年獲百種中國杰出學術期刊、中國出版政府獎先進出版單位;2014年獲中國高校醫學期刊最佳實踐獎、第五屆中國高校精品科技期刊獎、第3屆中國精品科技期刊;2015年獲中國醫藥衛生媒體最佳實踐創新獎、期刊數字影響力100強、第三屆中國高校科技期刊優秀網站獎;2016年獲中國高校百佳科技期刊;2017年獲第四屆中國精品科技期刊、中國高校科技期刊優秀團隊;2018年獲中國高校百佳科技期刊;2019年獲百種中國杰出學術期刊;2020年獲第5屆中國精品科技期刊、中國高校百佳科技期刊;2021年獲首屆西牛獎之十佳精品中文期刊和十佳新媒體平臺;2022年獲四川期刊年度優秀策劃、第二屆西牛獎精品中文科技期刊和優秀創新平臺、中國高校科技期刊建設示范案例杰出科技期刊;2023年獲第6屆中國精品科技期刊、中國高校科技期刊建設示范案例庫優秀團隊、第三屆西牛計劃之優秀編輯團隊。2019年入選中國科技期刊卓越行動計劃梯隊期刊項目。