自創(chuàng)刊以來，先后被列為“中國科技論文與引文數(shù)據(jù)庫（CSTPCD）”（1987年）、“中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫（CSCD）”（1989年）、“中國學(xué)術(shù)期刊綜合評價數(shù)據(jù)庫（CAJCED）”（2002）統(tǒng)計(jì)源來源期刊（均為數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建之年被收錄）。 自1998年中國科學(xué)技術(shù)信息研究所發(fā)布的首份《中國科技期刊引證報(bào)告》（核心版）以來，本刊均被評選為“中國科技核心期刊”。1997年的影響因子為0.324，上升至2021年的核心影響因子為1.743，在30本基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)類期刊中位列第一。 2004年入選為“中國科技期刊精品數(shù)據(jù)庫”。首次榮獲2009年度“百種中國杰出學(xué)術(shù)期刊”稱號。2010年、2013年、2017年分別遴選為第二、第三、第四屆“中國精品科技期刊”（2008年為首屆，遴選排名前300的國內(nèi)期刊）。2014-2017年連續(xù)4年被評選為“中國國際影響力優(yōu)秀期刊”。2011年以來，均被評選為“RCCES中國權(quán)威學(xué)術(shù)期刊（A+）”。 自1992年以中國基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)類核心期刊入編《中文核心期刊要目總覽》1992年版（第1版）以來，至今已連續(xù)入編至2023年版（第10版）。 2023年入選《科技期刊世界影響力指數(shù)（WJCI）報(bào)告》（2023年科技版），已連續(xù)4年。 2022年入選“預(yù)防醫(yī)學(xué)與衛(wèi)生學(xué)高質(zhì)量科技期刊分級目錄”（2021年版）。 1987年被美國醫(yī)學(xué)索引Medline檢索數(shù)據(jù)庫收錄（截止到2017年6月），并先后被Scopus（1987-1995,1998-2016,2021年7月2日被重新收錄）、Embase（1987-1995,1998-2016,2021年被重新收錄）、EBSCO（2014年起）、JSTChina（2007年起）、CABI（2003年起）、Zoological Record（1998年起）、WPRIM（1983年起）、Ulrichsweb (2009年起）、Google Scholar等數(shù)據(jù)庫收錄。